Các doanh nghiệp Việt Nam phải đối mặt với những thách thức mới khi tiếp cận với thị trường Nhật Bản như: khoảng cách về tiêu chuẩn và chất lượng; trình độ tiếng Nhật của nhân viên thấp; chi phí xúc tiến thương mại và nghiên cứu thị trường cao; chu kỳ bán hàng dài (1-2 năm), thiếu thông tin, kinh nghiệm ...